El Museo de Navarra es un museo general centrado en el patrimonio cultural navarro desde la prehistoria hasta la actualidad. La formación de sus colecciones se explica muy bien por su historia, desde las “antigüedades” que reunió la Comisión de Monumentos Históricos y Artísticos de Navarra, pasando por los bienes procedentes de las excavaciones y hallazgos arqueológicos, hasta el conjunto de pintura mural gótica que la Institución Príncipe de Viana descubría en las intervenciones de restauración que hacía en diferentes templos navarros en la década de los cuarenta del siglo XX y que, atendiendo a los criterios de la época, se arrancaba y traspasaba a lienzo con destino a un Museo de Navarra que estaba todavía en proyecto.

Cabe destacar el ingreso de los bienes procedentes de la catedral de Pamplona en 1948 (capiteles románicos de la fachada y del claustro, conjunto de pintura mural gótica, monetario); las grisallas renacentistas procedentes del Palacio de Oriz –donación de la familia Ferrer– en 1955; la Arqueta de Leire, asimismo, procedente de la seo pamplonesa, en 1966; el Retrato del Marqués de San Adrián, de Goya, también en 1966 –mediante adquisición a sus descendientes–; el conjunto de mobiliario y artes decorativas legadas por Josefina de Felipe en 1978; las obras de arte contemporáneo ganadoras de los Premios Navarra de Pintura y Escultura y los fondos fotográficos de los pioneros de la fotografía artística en Navarra, destacando las colecciones de Nicolás Ardanaz, Pedro María Irurzun, del estudio Zaragüeta de Pamplona y la reciente donación de la obra de Lydia Anoz.